MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 16372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011147	ATA	2	6	34	39	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011147	AT	3	6	94	99	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011147	CAG	2	6	103	108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011147	AGAC	2	8	192	199	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011147	ACA	2	6	220	225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011147	A	6	6	313	318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011147	T	8	8	342	349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011147	AAC	2	6	369	374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011147	A	7	7	5963	5969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011147	CGC	2	6	5970	5975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011147	TTG	2	6	7447	7452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011147	TGA	2	6	7467	7472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011147	ATG	2	6	7492	7497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011147	CGG	2	6	7544	7549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011147	CGT	2	6	7638	7643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011147	ATC	2	6	7647	7652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011147	CTGT	2	8	8705	8712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011147	CCTTC	2	10	8713	8722	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_011147	AAT	2	6	8761	8766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011147	GGA	2	6	9361	9366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011147	TAG	2	6	9373	9378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011147	TCC	2	6	9385	9390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_011147	GGA	2	6	9398	9403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011147	ATC	2	6	9993	9998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011147	ATA	2	6	10056	10061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011147	TAA	2	6	10090	10095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011147	GAAAA	2	10	10100	10109	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011147	TCTTT	2	10	11362	11371	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011147	TTA	2	6	11372	11377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011147	GTT	2	6	11401	11406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011147	ATTT	2	8	11409	11416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011147	TCTG	2	8	11430	11437	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011147	TCG	2	6	11456	11461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011147	A	6	6	11464	11469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011147	T	6	6	11470	11475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011147	TGA	2	6	11487	11492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011147	GTG	2	6	11527	11532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011147	A	8	8	11539	11546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011147	TTA	2	6	11581	11586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011147	ATG	2	6	11602	11607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011147	TTC	2	6	14783	14788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011147	GTAT	2	8	14798	14805	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011147	T	6	6	14814	14819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011147	TTG	2	6	14868	14873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011147	CAG	2	6	14910	14915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011147	A	8	8	14936	14943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011147	TGA	2	6	14951	14956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011147	T	6	6	14970	14975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011147	TAT	2	6	15003	15008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011147	T	7	7	15018	15024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011147	ATG	2	6	16034	16039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011147	CCT	2	6	16055	16060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_011147	ATT	2	6	16088	16093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011147	T	6	6	16511	16516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011147	TATTG	2	10	17609	17618	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011147	ATT	2	6	17645	17650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011147	GTT	2	6	17737	17742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011147	GTT	2	6	17761	17766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011147	ATC	2	6	17790	17795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011147	GAT	2	6	17802	17807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011147	T	6	6	17824	17829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011147	ACT	2	6	17942	17947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011147	CAA	2	6	17973	17978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011147	GAT	2	6	17981	17986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011147	AATA	2	8	18029	18036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011147	TTA	2	6	18070	18075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011147	TTG	2	6	18189	18194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011147	AGA	2	6	18223	18228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011147	GC	3	6	18399	18404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011147	CGG	2	6	18466	18471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011147	CCG	2	6	18501	18506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_011147	GTG	2	6	18542	18547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011147	GGGC	2	8	18615	18622	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011147	AGA	2	6	18637	18642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011147	GCT	2	6	18658	18663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011147	GCT	2	6	18779	18784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011147	TGA	2	6	18804	18809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011147	CTT	2	6	18817	18822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011147	CCA	2	6	18850	18855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_011147	GGCTG	2	10	18884	18893	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_011147	CTG	2	6	18914	18919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011147	CGC	2	6	19005	19010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_011147	TAC	2	6	19042	19047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011147	CGCTGA	2	12	19156	19167	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011147	CGC	2	6	19212	19217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_011147	CTGGGC	2	12	19253	19264	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011147	CGTG	2	8	19315	19322	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011147	CGA	2	6	19420	19425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011147	GCG	2	6	19454	19459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011147	TTC	2	6	19510	19515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011147	TGA	2	6	19516	19521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011147	A	6	6	19623	19628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011147	CGG	2	6	19701	19706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011147	GAA	2	6	19745	19750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011147	GAA	2	6	19778	19783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011147	GAT	2	6	19802	19807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011147	CAG	2	6	19812	19817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011147	TGG	2	6	19925	19930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011147	CCTGA	2	10	19946	19955	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_011147	CGG	2	6	19966	19971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011147	CCA	2	6	20064	20069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_011147	TTA	2	6	23199	23204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011147	TCTTAA	2	12	23236	23247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_011147	TTAT	2	8	23298	23305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011147	AT	3	6	24089	24094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011147	TAA	2	6	24128	24133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011147	AAG	2	6	24155	24160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011147	ATT	2	6	24161	24166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011147	A	6	6	24169	24174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011147	ACA	2	6	24228	24233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011147	GAT	2	6	24265	24270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011147	TAA	2	6	24292	24297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011147	TAA	2	6	24299	24304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011147	ACG	2	6	24339	24344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011147	AAG	2	6	24386	24391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011147	T	7	7	24396	24402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011147	GAA	2	6	24432	24437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011147	CAG	2	6	24442	24447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011147	A	6	6	24458	24463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011147	T	7	7	25058	25064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011147	CG	3	6	25097	25102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011147	TGC	2	6	30058	30063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011147	GGC	2	6	30065	30070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011147	CT	3	6	30138	30143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_011147	CG	3	6	30201	30206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_011147	GCA	2	6	30256	30261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011147	GCG	2	6	30268	30273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011147	CG	3	6	30464	30469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011147	GGC	2	6	30483	30488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011147	GGT	2	6	32497	32502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011147	GT	3	6	33074	33079	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011147	ATA	2	6	33167	33172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011147	T	6	6	33179	33184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011147	T	6	6	33187	33192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011147	T	6	6	33219	33224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011147	CAT	2	6	33234	33239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011147	TTTTA	2	10	33244	33253	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011147	TAA	2	6	33288	33293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011147	GTG	2	6	33333	33338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011147	ATG	2	6	33360	33365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011147	ATA	3	9	34879	34887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011147	T	6	6	34933	34938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011147	ATCGT	2	10	34948	34957	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_011147	ATG	2	6	34967	34972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011147	T	6	6	34974	34979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011147	ATTTT	2	10	34992	35001	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_011147	ATTTT	2	10	35252	35261	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011147	ATT	2	6	35264	35269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_011147	TTG	2	6	35321	35326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_011147	AT	3	6	40116	40121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_011147	GGC	2	6	41175	41180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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425	NC_011147	A	6	6	130180	130185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_011147	CTGG	2	8	130190	130197	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
427	NC_011147	CAT	2	6	130279	130284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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430	NC_011147	CTG	2	6	130342	130347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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432	NC_011147	GAC	2	6	130376	130381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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436	NC_011147	TGA	2	6	130495	130500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_011147	ATT	2	6	137267	137272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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